Ještě před povznesením započali Antikové experiment Destiny. Jeho klíčovou úlohu sehrává stejnojmenná loď, která již tisíce let křižuje vesmírem s jediným posláním – neustále rozšiřovat síť bran. Antikové si byli jistí, že život existuje v rozmanité podobě po celém vesmíru a hvězdné brány představovaly ideální prostředek k dalšímu objevování. Antikové se však k tomuto experimentu nikdy nevrátili, protože objevili povznesení. Loď Destiny a celý experiment je námětem seriálu Stargate Universe.
Dr. Daniel Jackson rozluští adresu brány na ztracené město Antiků – Atlantis – v galaxii Pegasus. Expedice Atlantis, vedená Dr. Weirovou zajistí město, které se přitom neočekávaně vynoří na hladinu, a začnou prozkoumávat antické technologie i okolní planety.
Po nechtěném probuzení spících Wraithů se Atlantis stává hlavním cílem jejich útoků. Díky tomu, že Wraithové pozemšťany podcenili, byli lidé schopni odrazit první vlnu útoku. Za použití antických technologií města a asgardských technologií na lodích Daidalos a Apollo vedou lidé s novými spojenci v galaxii Pegasus válku proti Wraithům i proti Asuranům.
Vít Dlouhý